No dia do casamento de Borisov no trono, os boiardos calculam os frutos de seu reinado: a pestilência reprimida, as guerras concluídas e as colheitas. Eles ficam surpresos com o tempo que Godunov teve que convencê-lo a tomar o poder, e apenas a ameaça de excomunhão o forçou a fazê-lo. Boris retorna da catedral, pretendendo receber embaixadores. Voeikov anuncia a vitória sobre o Khan siberiano. O embaixador inglês oferece a noiva a Tsarevich Fedor; núncio papal - um acordo sobre a unificação de igrejas; Os embaixadores austríacos, lituanos, suecos e florentinos respeitosamente pedem ajuda a alguém com dinheiro ou tropas, que reconhecem seus bens. Os embaixadores persas e turcos acusam-se de invadir Iberia, o embaixador do rei ibérico pede proteção. O czar dá uma resposta adequada a todos, cheio de dignidade e força, e ordena que todos sejam autorizados a entrar nas câmaras reais ("Não há barreira entre o povo russo e o czar!"). Deixado sozinho, Boris triunfa e, lembrando a morte do príncipe, decide: então o preço inevitável da grandeza do estado. Logo depois, enquanto esperava na cela do mosteiro o corte de cabelo de Irina, Boris escuta os relatos de Semyon Godunov para os Romanov, que estão descontentes com o cancelamento do dia de São Jorge; contra Vasily Shuisky, um servo astuto e não confiável, mas confiante em sua força, ele não quer punir ninguém. Irina aparece e Boris, lembrando-a de suas vacilações a caminho do poder, pede para justificá-lo e admite que a prosperidade da Rússia vale a mentira pela qual ele se tornou rei. Irina, aprovando seu reino, exige que ele não esqueça sua culpa e não se perdoe. Deixados sozinhos, eles se separam.

No palácio, os filhos de Boris, Fyodor e Xenia ouvem as histórias de Christian, o duque dinamarquês, o noivo de Xenia - sobre uma infância dura, sobre retornar à corte, sobre batalhas na Flandres com as tropas espanholas, mas quando Fedor reclama de sua ociosidade, Christian percebe que sua posição, que lhe permite estudar o governo sob um soberano sábio, é muito mais digna. Christian conta como amou Ksenia de acordo com as histórias de embaixadores, comerciantes e prisioneiros, que glorificaram junto com a grandeza da Rússia a beleza, a inteligência e a mansidão da princesa. Eles começam a falar sobre Boris, e todos concordam em amar o czar, que se esquece da glória e do bem-estar do estado. Todos os três juram ajudar um ao outro. Christian pede a Boris, que entrou, em caso de guerra, para permitir que as tropas russas liderem, mas o czar fica desencorajado pela paz que existe há muitos anos. As crianças vão embora, e Semyon Godunov, que veio, anuncia um boato sobre o príncipe maravilhosamente salvo Dimitri. Nos seus aposentos, a czarina Maria Grigoryevna pergunta ao escriturário Vlasyev sobre o cristianismo e, por mais que Juliet Vlasyev seja, descobre que havia uma sensação de que o rei não era seu pai, e seu irmão mais velho, agora reinante, não gosta dele. Não cumprindo a promessa do funcionário de testemunhar a Boris, ela liga para Dementyevna e com crescente irritação descobre que Ksenia estava sentada com seu irmão e noivo, e o czar acolhe novos costumes. A czarina que veio a Volokhov reclama que Boris pegou Ksenia pelos alemães sem perguntar a ela, e os alemães, aparentemente, ligaram a princesa. Volokhov compromete-se a adivinhar qual é a força do cristão e esmagá-lo ("Existe uma raiz"). Na floresta, no campo dos ladrões, Ataman Khlopko aceita um novo reabastecimento dos camponeses, amaldiçoando Boris e a abolição do dia de São Jorge. Aparece um Posadsky, que, sem medo, exige libertar seus companheiros capturados na estrada de Moscou por um sentinela de assaltantes e relata as verdadeiras notícias sobre o aparecimento de Tsarevich Dimitri. Posadsky vence Khlop para ir a Bryansk e lá, depois de molestar as tropas do czarévique, recebe perdão e luta contra Godunov. Mitka aparece, arrastando dois monges fugitivos, Mikhail Povadin e Grishka Otrepyev, que estão pedindo para se juntar ao exército do algodão. Quando Posadsky, tendo divertido os ladrões lutando com Mitka e mandado estender barris de vinho, desaparece subitamente, acontece que os monges que caminhavam com ele não sabem quem ele é.

Boris é forçado a admitir que o surgimento de um novo inimigo o levou a um caminho sangrento. Semyon Godunov, encarregado de descobrir quem está escondido atrás do nome de Demétrio, diz que não sabia de nada à custa da tortura. Eles procuram o nome de Grishka Otrepyev, um monge milagroso fugitivo, para de alguma forma renomear o inimigo. Boris ordena multiplicar os espiões e encontrar evidências sobre os Romanov e, além disso, por causa da fome em curso, entregar o tesouro ao povo, ordenando que ele não ouça as fábulas sobre o príncipe. Tsarevich Fedor pede para enviá-lo para as tropas, Tsarevna Ksenia lamenta a mudança em Boris e sua crueldade; Um cristão pergunta se Boris tem certeza da morte do tsarevich e reconta rumores. As crianças vão embora, a rainha aparece, cheia de causticidade e irritação para o cristão, interpretando com as crianças sobre o "rei". O rei continua surdo à sua exigência de mandar o cristão embora. Semyon Godunov relata o rápido avanço dos traidores, a transferência de tropas para eles e a resistência obstinada de Basmanov. Vasily Shuisky oferece a Boris que vá até as tropas ou envie a rainha viúva para testemunhar a morte de seu filho. Depois de ordenar que Shuisky dissolvesse idiomas aos que espalham boatos, Boris envia Dimitry para sua mãe. Na casa de Fedor Nikitich Romanov, os boiardos Romanovs, Sitsky, Repnin e Cherkassky bebem para o príncipe. Shuisky chega, relata a ordem de Boris, é questionado sobre sua busca em Uglich, responde vagamente. Semyon Godunov com arqueiros, tendo acusado a platéia de querer envenenar o soberano com veneno, leva todos sob custódia, equipando Vasily Shuisky para conduzir um interrogatório. Boris, refletindo sozinho em uma previsão cumprida (“Morto, mas vivo”), que veio a Shuisky ordenou declarar no Forefront que ele próprio havia visto o cadáver do czar em Uglich. Enquanto isso, conselheiros estão pressionando Christian, explicando que ele deveria se recusar a se casar com Ksenia, que Boris se traiu de medo, que Ksenia é filha de um vilão e um servo. Christian, sentindo a tontura que se aproxima, acreditando na culpa de Boris, não sabe o que decidir. Ksenia chega e ele, confuso em palavras e pensamentos, fala da inevitável separação e depois a chama para fugir dele do pai assassino. Fyodor, que entrou em silêncio, defende o pai, eles vão brigar, Ksenia, chorando, lembra-se do juramento dado um ao outro. Delírios cristãos e, considerando-o doente, Ksenia e Fedor o levam embora.

Na Praça Vermelha, os detetives ouvem conversas entre pessoas que caminham do requiem para Tsarevich Dimitri (o anátema de Grishka foi proclamado no mesmo local). Provocando, interpretando a fala de maneira adequada a eles, os detetives agarram quase todo mundo em uma fila. Vasily Shuisky, do Local de Execução, faz um discurso ambíguo sobre o inimigo que está avançando e fala sobre a busca em Uglich, para que não fique claro quem era o bebê assassinado. Nessa época, a mãe do príncipe, trazida do mosteiro, agora a freira Marta, esperando Boris e querendo vingança, decide reconhecer o impostor como filho; ela diz que não viu o filho morto, tendo perdido sentimentos, e no serviço memorial as lágrimas cobriram seus olhos. Agora, tendo ouvido falar dos sinais do tsarevich que apareceu, ele admite que foi milagrosamente salvo e vivo. Tsaritsa Maria Grigoryevna, querendo condenar o engano, apresenta Volokhov. A dor que tomou conta de Martha ao ver o destruidor de seu filho a trai, mas ela se recusa a admitir a morte de Demétrio publicamente. Logo, o médico relata a Boris sobre a deterioração da saúde de Christian e sobre sua impotência. Semyon Godunov traz uma carta de Dimitry Ioannovich, na qual Boris está mais deprimido da misericórdia prometida no caso de uma abdicação voluntária do trono e, portanto, da confiança do ladrão no apoio universal. Boris exige trazer um Kleshnin de cabelos curtos para ter certeza da morte do príncipe. O nome dele é cristão e ele logo informa Xenia e Fedor sobre sua morte.

Duas sentinelas, carregando um guarda noturno na câmara do trono, se escondem com medo quando o insone Boris aparece. Alguém imagina a imagem de alguém no trono e, encontrando as sentinelas, ele as envia para verificar quem está sentado lá. Semyon Godunov traz Kleshnin, que confirma a morte de Demétrio, lembra que o termo do reinado de Borisov, previsto pelos Magos, está chegando ao fim, o convida a se arrepender e a sair para o mosteiro. De manhã, depois de receber informações de Basmanov que chegaram sobre a vitória parcial sobre o "ladrão", Boris conta a Fedor sobre a necessidade de se casar com o trono e sobre o juramento a que os boiardos serão trazidos. Fedor abandona o trono, pois não tem certeza de que o "ladrão" não seja Demétrio. Boris oferece, significativamente, apresentar a Fedor as indiscutíveis evidências da morte do czarévique, e ele, tendo compreendido o crime de seu pai, recusa horrorosamente as evidências e declara que aceitará a coroa. Na sala de jantar, à espera de Basmanov e do rei, os boiardos amaldiçoam os dois e trocam notícias do "príncipe". Basmanov entra, reclamando de sua excomunhão inadequada. Boris aparece com as crianças. Boris recompensa Basmanov. Os boiardos, notando a tristeza de Xenia, têm pena dela e se perguntam o que fazer com ela "quando ele chega ao reino". Boris exige um juramento de fidelidade a Fedor e a aprovação deste juramento na catedral perde força e cai. Com confusão geral, ele declara que a causa de sua morte não é veneno, mas a tristeza faz com que os boiardos prestem juramento, lembra que “somente o mal nascerá do mal” e, declarando o rei Fedor, parte